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柯南一行人在露营的回家途中顺道参观一座位于西多摩市境内即将在近期完成的全日本最高双塔摩天大楼。一行人在秘书的带领之下参观了这座两栋长的一模一样的最尖端高科技双塔摩天大楼。但是，此时在这摩天大楼里却出现了多位与此建筑物有着不同关系的人士！不久之后第一个杀人事件发生了……。而且，令人不敢相信的是《黑暗组织》的成员竟然同时也在大楼附近出现，何的劝说，双塔摩天大楼的开幕典礼仍然按照预定进行。为了查出这场发生在总楼层高300公尺的高科技摩天大楼的杀人事件真相，柯南将与其宿敌——也就是当初逼迫工藤新一喝下毒药使他身体缩小的凶手——《黑色组织》展开一场史上最恐怖的攻防战……
编辑：我爱你哦動漫社